产品货号:
WH0130
中文名称:
植物miRNA提取分离试剂盒
英文名称:
miRsmart Plant miRNA Isolation Kit
产品规格:
50次
发货周期:
1~3天
产品价格:
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本试剂盒可从植物组织,特别是富含多糖多酚或淀粉的植物组织(如棉花叶片,马铃薯块茎,苹果,桃树叶片等)中快速提取包含miRNA的总RNA,可同时处理大量不同样品。提取的总RNA纯度高,没有蛋白和其它杂质的污染。提取物可用于RT-PCR、Real Time RT-PCR、芯片分析、Northern Blot、Dot Blot、PolyA筛选、体外翻译、RNase保护分析和分子克隆等多种下游实验。
试剂盒特点:
试剂盒组成:
储存条件:室温(15~25℃),加入β-巯基乙醇的裂解液SLM 4℃可放置一个月。
预防RNase污染,应注意以下几方面:
注意事项:
操作步骤:
第一次使用前在漂洗液RWA和去蛋白液MRD中加入无水乙醇,加入量请参见瓶上标签。
一、miRNA富集部分的提取
对miRNA的纯度要求较高时,比如miRNA芯片研究、miRNA克隆建议采用此方法。
二、Total RNA的提取
提取的total RNA中含有miRNA等small RNA。对miRNA的纯度要求不高时,比如在研究miRNA RT-PCR、miRNA Northern blot时也可以采用此方法。
RNA纯度及浓度检测:
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试剂盒特点:
- 裂解液特别优化,并配有助沉剂,专为多糖多酚植物样本的裂解设计,得率更高。
- 柱法纯化,摆脱杂质污染,纯度更高,适合下游定量检测。
- 功能全面,除了小片段的提取,还能进行总RNA的提取。
- 1h内即可提取完毕,提高提取效率。
试剂盒组成:
组分 | 规格 |
裂解液SLM | 30mL |
助沉剂PLA | 3mL |
漂洗液RWA | 12mL |
去蛋白液MRD | 24mL |
RNase-Free ddH2O | 15mL |
RNase-Free过滤柱CS(含2mL收集管) | 50套 |
RNase-Free吸附柱miRspin(含2mL收集管) | 50套 |
RNase-Free吸附柱CR4(含2mL收集管) | 50套 |
RNase-Free离心管(1.5mL) | 50个 |
储存条件:室温(15~25℃),加入β-巯基乙醇的裂解液SLM 4℃可放置一个月。
预防RNase污染,应注意以下几方面:
- 经常更换新手套。因为皮肤经常带有细菌,可能导致RNase污染。
- 使用无RNase的塑料制品和枪头避免交叉污染。
- RNA在裂解液中不会被RNase降解。但提取后继续处理过程中应使用不含RNase的塑料和玻璃器皿。玻璃器皿可在150℃烘烤4h,塑料器皿可在0.5M NaOH中浸泡10min,然后用水彻底清洗,再灭菌,即可去除RNase。
- 配制溶液应使用无RNase的水(将水加入到干净的玻璃瓶中,加入DEPC至终浓度0.1% (v/v),放置过夜,高压灭菌)。
注意事项:
- 操作前在裂解液SLM中加入β-巯基乙醇至终浓度5%,如475μL裂解液SLM中加入25μL β-巯基乙醇。此裂解液最好现用现配。配好的试剂4℃可放置一个月。
- 第一次使用前应在去蛋白液MRD和漂洗液RWA中加入无水乙醇,加入量请参见瓶上标签。
- 提取操作均在室温进行。
操作步骤:
第一次使用前在漂洗液RWA和去蛋白液MRD中加入无水乙醇,加入量请参见瓶上标签。
一、miRNA富集部分的提取
对miRNA的纯度要求较高时,比如miRNA芯片研究、miRNA克隆建议采用此方法。
- 匀浆处理
50mg植物叶片或果实果肉在液氮中迅速研磨成粉末,转入到1.5mL离心管中,加入500μL裂解液SLM(使用前请先检查是否已加入β-巯基乙醇),颠倒混匀以保证裂解液浸没所有样本,再加入1/10裂解液体积的助沉剂PLA,立即涡旋震荡混匀。
注意:
① 对于预期RNA得率小于10μg的植物样本,请使用100mg的起始样本量;对于富含淀粉的样本或成熟叶片,请将裂解液SLM用量增加至700μL。
② 由于植物多样性非常丰富,而且同种植物的不同生长发育阶段和不同组织RNA含量都不相同,请根据具体实验情况选择合适的样本量。 - 室温,12000rpm(~13400×g)离心5min。
- 将上清液转移至过滤柱CS上(过滤柱CS放在收集管中),室温12000rpm(~13400×g)离心2min,小心吸取收集管中的上清至新的RNase-Free的离心管中,吸头尽量避免接触收集管中的细胞碎片沉淀。
- 量取转移液的体积,缓慢加入转移液体积0.43倍的无水乙醇(如:500μL的转移液加215μL无水乙醇),混匀(此时可能会出现沉淀)。将得到的溶液和沉淀一起转入吸附柱miRspin中,室温12000rpm (~13400×g)离心30sec。若一次不能全部加入到吸附柱miRspin中,请分两次转入,离心后弃掉吸附柱miRspin,保留流出液。
- 量取流出液的体积,缓慢加入流出液体积0.75倍的无水乙醇(如:700μL的流出液加525μL无水乙醇),混匀(此时可能会出现沉淀)。将得到的溶液和沉淀一起转入吸附柱CR4中,室温12000rpm (~13400×g)离心30sec,若一次不能全部加入到吸附柱CR4中,请分两次转入,离心后弃掉流出液,保留吸附柱CR4。
- 向吸附柱CR4中加入700μL去蛋白液MRD(请先检查是否已加入乙醇),室温静置2min,室温12000rpm (~13400×g)离心30sec,弃废液。
- 向吸附柱CR4中加入500μL漂洗液RWA(请先检查是否已加入乙醇),室温静置2min,室温12000rpm (~13400×g)离心30sec,弃废液。
- 重复操作步骤7。
- 将吸附柱CR4放入2mL收集管中,室温12000rpm (~13400×g)离心2min,去除残余液体。
注意:此步骤目的是将吸附柱中残余的漂洗液去除,离心后将吸附柱CR4在室温放置2min,或置于超净工作台上通风片刻,以充分晾干。如果有漂洗液残留,可能会影响后续的RT等实验操作。 - 将吸附柱CR4转入一个新的RNase-Free 1.5mL离心管中,加50μL RNase-Free ddH2O,室温放置2min,室温12000rpm (~13400×g)离心2min。
注意:
① 洗脱缓冲液体积不应少于30μL,体积过小影响回收效率。且RNA应保存在-70℃,以防降解。
② 如果想提高RNA得率,可重复上步操作一次。
二、Total RNA的提取
提取的total RNA中含有miRNA等small RNA。对miRNA的纯度要求不高时,比如在研究miRNA RT-PCR、miRNA Northern blot时也可以采用此方法。
- 匀浆处理
50mg植物叶片或果实果肉在液氮中迅速研磨成粉末,转入到1.5mL离心管中,加入500μL裂解液SLM (使用前请先检查是否已加入β-巯基乙醇),颠倒混匀以保证裂解液浸没所有样本,再加入1/10裂解液体积的助沉剂PLA,立即涡旋震荡混匀。
注意:
① 对于预期RNA得率小于10μg的植物样本,请使用100mg的起始样本量;对于富含淀粉的样本或成熟叶片,请将裂解液SLM用量增加至700μL。
② 由于植物多样性非常丰富,而且同种植物的不同生长发育阶段和不同组织的RNA含量都不相同,请根据具体实验情况选择合适的样本量。 - 室温,12000rpm(~13400×g)离心5min。
- 将上清液转移至过滤柱CS上(过滤柱CS放在收集管中),12000rpm(~13400×g)离心2min,小心吸取收集管中的上清至新的RNase-Free的离心管中,吸头尽量避免接触收集管中的细胞碎片沉淀。
- 缓慢加入1.5倍上清体积的无水乙醇,混匀(此时可能会出现沉淀),将得到的溶液和沉淀一起转入吸附柱CR4中,12000rpm(~13400×g)离心30sec,倒掉收集管中的废液,将吸附柱CR4放回收集管中。若一次不能全部转入吸附柱CR4,请分两步进行。
注意:如果上清液体积有损失,请相应调整无水乙醇的加量。 - 向吸附柱CR4中加入700μL去蛋白液MRD(使用前请检查是否已加入乙醇),12000rpm(~13400×g)离心30sec,倒掉收集管中的废液,将吸附柱CR4放回收集管中。
- 向吸附柱CR4中加入500μL漂洗液RWA (使用前请先检查是否已加入乙醇),12000rpm(~13400×g)离心30sec,倒掉收集管中的废液,将吸附柱CR4放回收集管中。
- 重复步骤6。
- 将吸附柱CR4放入2mL收集管中,室温12000rpm (~13400×g)离心2min,去除残余液体。
注意:此步骤目的是将吸附柱中残余的漂洗液去除,离心后将吸附柱CR4在室温放置2min,或置于超净工作台上通风片刻,以充分晾干。如果有漂洗液残留,可能会影响后续的RT等实验操作。 - 将吸附柱CR4转入一个新的RNase-Free 1.5mL离心管中,加50μL RNase-Free ddH2O,室温放置2min,室温12000rpm (~13400×g)离心2min。
注意:
① 洗脱缓冲液体积不应少于30μL,体积过小影响回收效率。且RNA应保存在-70℃,以防降解。
② 如果想提高RNA得率,可重复上步操作一次。
RNA纯度及浓度检测:
- 完整性:RNA可用普通琼脂糖凝胶电泳(电泳条件:胶浓度1.2%;0.5×TBE电泳缓冲液;150 V,15min)检测完整性。由于细胞中70~80%的RNA为rRNA,电泳后UV下应能看到非常明显的rRNA条带。rRNA大小分别约为5 kb和2 kb,分别相当于28S和18S rRNA;植物叶片中由于含有大量的叶绿体RNA,可见4条或更多rRNA。植物RNA样品中最大rRNA亮度应为次大rRNA亮度的1.5~2.0倍,否则表示RNA样品的降解。出现弥散片状或条带消失表明样品严重降解。
- 纯度:OD260/OD280比值是衡量蛋白质污染程度的指标。高质量的RNA,OD260/OD280读数在1.8~2.1之间,比值为2.0是高质量RNA的标志。OD260/OD280读数受测定所用溶液的pH值影响。同一个RNA样品,假定在10mM Tris,pH7.5溶液中测出的OD260/OD280读数1.8~2.1之间,在水溶液中所测读数则可能在1.5~1.9之间,但这并不表示RNA不纯。
- 浓度:取一定量的RNA提取物,用RNase-Free ddH2O稀释n倍,用RNase-Free ddH2O将分光光度计调零,取稀释液进行OD260,OD280测定,按照以下公式进行RNA浓度的计算:
终浓度(ng/μl)= (OD260)×(稀释倍数n)×40
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